(1) اختيار المعدات. هناك بعض المشاكل في اختيار المعدات الصيدلانية، مثل الاختيار بناءً على الخبرة (بدون حسابات فعلية، أو حسابات بيانات غير كافية)، والسعي الأعمى وراء التقدم، وعدم كفاية البحث في البيانات الفيزيائية، مما يؤثر بشكل خطير على جدوى المعدات واقتصاديتها.

(2) تركيب المعدات والتدريب. في عملية تركيب المعدات الصيدلانية، غالبًا ما يُولى اهتمام كبير لتقدم عملية التركيب، مع إهمال جودة التركيب، مما يؤدي إلى زيادة تكاليف صيانة المعدات لاحقًا. إضافةً إلى ذلك، يُشكل عدم كفاية تدريب موظفي صيانة وتشغيل المعدات مخاطر على إدارة وصيانة المعدات الصيدلانية.

(3) عدم كفاية الاستثمار في إدارة وصيانة أنظمة المعلومات. على الرغم من أن العديد من الشركات تولي أهمية كبيرة لإدارة وصيانة المعدات، وكذلك إدارة سجلات صيانة المعدات وتسجيل المعايير الأساسية، إلا أن بعض المشكلات لا تزال قائمة، مثل صعوبة توفير بيانات الصيانة المستمرة، ونقص معلومات مواصفات المعدات الصيدلانية الفعالة، كالمواصفات والرسومات، مما يزيد من صعوبة إدارة المعدات وصيانتها وإعادة تأهيلها.

(4) نظام الإدارة. يؤدي غياب نظام وأساليب إدارة فعالة إلى عدم كفاية إدارة موظفي صيانة المعدات الصيدلانية، وعدم توحيد عمل موظفي الصيانة، ووجود مخاطر خفية تتعلق بالسلامة في عملية إدارة وصيانة المعدات الصيدلانية.